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李国亮团队在环状RNA生物发生关键调控因子的研究中取得新进展
家庭教师av发布日期 2025-06-04 家庭教师av浏览次数

(来源 | BioartMED  编辑 | 辛西  审核 | 李国亮)近日,家庭教师av 李国亮教授研究团队在BMC Biology上发表题为Transcriptome analysis reveals PTBP1 as a key regulator of circRNA biogenesis 的最新研究进展。该研究揭示了多聚嘧啶束结合蛋白1(PTBP1)在整体环状RNA(circRNA)生物发生中的关键调控作用,并指出其与急性髓性白血病(AML)circRNA表达的相关性,为白血病治疗提供了新见解。

CircRNA是一类特殊的非编码RNA分子,通过反向剪接形成稳定的共价闭合结构,具有组织特异性、疾病特异性和高稳定性等特点,在细胞生物学过程中扮演重要角色,如作为miRNA海绵间接调控基因表达。然而其生物发生的调控机制尚未完全明确。

研究团队通过深入分析10种细胞系的全转录组数据,首次发现PTBP1是调控circRNA生物发生的关键RNA结合蛋白。研究过程中,团队成员首先通过RNA测序技术,全面分析了不同细胞系中circRNA的表达谱,并构建了circRNA的共表达网络,从而揭示了circRNA在不同细胞系中的表达具有显著的细胞特异性。进一步分析发现,circRNA的侧翼内含子区域高度富集PTBP1结合的特征序列,这为PTBP1调控circRNA生物发生提供了重要线索。通过构建PTBP1的敲低细胞系,研究人员发现,PTBP1的敲低导致circRNA的整体表达水平显著下降,而宿主基因的线性转录本变化不大。此结果表明,PTBP1对circRNA的调控独立于线性转录本的剪接过程,揭示了PTBP1在circRNA生物发生中的独特作用机制。研究团队进一步构建了基于SPPL3基因的小基因报告系统,证实PTBP1能结合circSPPL3的侧翼内含子区域,且PTBP1结合位点的突变会阻碍circSPPL3的反向剪接。此外,利用miniGFP系统验证了PTBP1结合位点在侧翼内含子中的协同作用对circRNA生物发生的必要性。

研究人员通过对AML临床样本的分析,发现PTBP1和circRNA在AML中均显著上调,且PTBP1高表达与AML患者低生存率相关。基于这些发现,进一步构建了PTBP1相关的竞争性内源RNA(ceRNA)网络,揭示了PTBP1可通过调控circRNA的表达,间接影响miRNA与mRNA的相互作用,从而参与细胞增殖等生物学过程。

综上所述,这一研究成果首次确定了PTBP1对整体circRNA生物发生的调控作用,并表明PTBP1与白血病circRNA表达之间的潜在关联,为临床治疗策略提供了新的可能性。

家庭教师av 已毕业博士研究生王墨涵和已毕业硕士研究生郑姗姗为论文共同第一作者,家庭教师av 李国亮教授为论文通讯作者。李兴旺教授给予课题指导。

论文链接://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-025-02233-8




原文链接://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4OTY0NzE1NQ==&mid=2247648316&idx=4&sn=7667d8adcecd51e8633382720cafa4e3&chksm=fcd18d038a3f47fa262a51d5e97d5aad69519582f65231b76bba9f0b4b2aa41459449010f74b&mpshare=1&scene=23&srcid=053168nQXvWFASscQ7LLJXh5&sharer_shareinfo=33e1a2ece9cdb2339ac1dde6b984a51f&sharer_shareinfo_first=177fe27b29f4991d2fe50fb75a7f1f1c#rd